Үлкен геномдық тізбектерді теңдестіру
Екі тізбек арасындағы өте ұқсас аймақтарды табу
Ұқсастық, қайта ұйымдастыру және т.б. бөлшектеруге мүмкіндік
Мәселелер:
Қиын процесс
Масштабтылық, көптеген геномдық тізбіктер анықталуда
Уақыт шектеулігі
Теңдестіру стратегиясы
Барлық кодтайтын экзондарды қолданыңыз
Ең жақсы кері попадание кешенін алыңыз
Ортологтар картасын құрастырыңыз
Мульти жаһандық теңдестіру құрастырыңыз
PhD докторы Коразбекова К.У.,
Синтетикалық аймақтар
Геномдық теңдестіру үлкен синтетикалық аймақтардан тұрады
Теңдестірулер берге кластерленеді, егер олардың арасындағы
қашықтық 100 кб аз, реттілік және бағыт берік болса
100 кб аз кез-келген кластерлер жасалынбайды
Достарыңызбен бөлісу: |