Вирусы проникают в кровяное русло и с током крови вирус заносятся во внутренние органы и ткани, преимущественно в печень, селезенку, легкие, костный мозг, лимфатические узлы,
После размножения в органах вирусы вновь могут попадать в кровь, вызывая повторную вирусемию.
Поэтому энтеровирусные инфекции часто имеют волнообразный характер.
Вирусемия прекращается после появления специфических антител
Лишь менее, чем у 2% инфицированных вирус проникает в ЦНС
Размножение вируса в ЦНС происходит в основном в мотонейронах (имеют рецептор СD155).
Преимущественно поражаются рога серого вещества спинного мозга, а также ядра продолговатого мозга и варолиева моста.
Мозаичность и неравномерность поражений в спинном мозге определяет различную локализацию и степень выраженности вялых параличей или парезов мышц конечностей, туловища, шеи, межреберной мускулатуры.