АИТВ-ның инкубациялық кезеңі (АИТВ-инфекциясының жұқтырған кезден бастап алғашқы белгілеріне дейінгі кезең) 14 күннен 3 айға дейін, бірақ ол 1 жылға дейін созылуы мүмкін. Осы кезеңде вирусқа қарсы антиденелерді анықтау әлі мүмкін болмады, сонымен қатар симптомдар жоқ.
Адамның иммун тапшылығы вирусы ағзаға енгеннен кейін, ең алдымен, CD4 + лимфоциттерге, макрофагтарға және кейбір басқа жасушаларға шабуыл жасайды, олардың ішіне еніп, белсенді түрде көбейе бастайды. Нәтиже - бұл жасушалардың өлімі, соның салдарынан иммундық жүйе шамалы ауруларға, инфекцияларға және сау иммунитеті бар адам жауап бермейтін басқа патологиялық факторларға барабар жауап бере алмайды.
