Белоктардың негізгі қызметтері – геномда кодталған барлық белоктарды ашу және оларды белгілі бір топтарға – ферменттерге, тасымалдаушы белоктарға, құрылымдық белоктарға жатқызу
Белоктардың физиологиялық қызметтері – молекулалардың биологиялық белсенділігін анықтау немесебелок жүйелері (транскрипция аппараты, репликация, метаболизм және т.б.)
Геномдық талдау геном қызметінің биохимиялық деңгейінің күрделі және екіұшты екенін көрсетеді:
Әрбір реттелген геномда белгісіз қызметі бар гендер болады
Геномның күрделілігі артқан сайын белгілі функциялар туралы ақпарат көлемі азаяды
Функция басқа белгілі белоктармен гомология негізінде анықталады
Бұл ереже әрқашан жұмыс істемейді: бактериялардағы nif гені азотты бекітуге қатысады, ашытқы және басқа организмдерде ол басқа функцияларды орындайды. Қ ұрылым гомологиясы = функция аналогиясы