Стационарлық емдеу арнайы бөлімшелерде немесе реанимация бөлімшесінде,интенсивті терапия бөлімшесінде жүргізіледі.Реабилитацияның стационардағы маңыздылығы оның госпитализациясы,диагностикасы,интенсивті терапия және де,бұзылған мүшені тезірек қалпына келтіру үшін медикаментозды емдеу әдістерін қолдану болып табылады.
Бұл этаптың міндеттері:реабилитациялық шараларды жүргізуді қажет ететінін дәлелдеу,бастапқы кезеңде пациенттің физикалық реабилитация бастауда жеке бағдарлама құру,прсихологиялық ауытқулар бар жоғын анықтау.Реабилитациялық шараларды жасауда пациент және оның отбасыларын оқыту.