Мұхаммед пайғамбар ﷺ қайтыс болғаннан кейін халифаны, яғни оның "орынбасарын" сайлау керек деген сұрақ туындаған кезде Әбу Бәкір осы қызметке сайланды. Ол билікте екі жыл болды, содан кейін ол қайтыс болды, бірақ осы екі жылдың ішінде исламнан бас тартқан тайпаларды дінге қайта оралуға көндірді.Ислам тарихы Әбу Бәкір исламның таралуы үшін көп жұмыс жасады: ол кезде ең қуатты империялар болған Персия мен Византияға қарсы соғыс бастады. Қайтыс болу қарсаңында Әбу Бәкір Омарды (Омарды) өзінің мұрагері етіп тағайындады.