Ослаблению и распаду Могулистана способствовали:раздробленность страны на уделы племенной знати; распри в династии Чагатаидов; внешние войны; недовольство народных масс постоянной нестабильностью и поборами, выливавшееся в кочевой среде в массовые откочевки; завершение процесса формирования тюркских и тюркизированных племен Семиречья в Старший жуз, а вместе с племенами всего Казахстана в казахскую народность.
В начале XVI в. государство Могулистан прекратило свое существование. С 60-х гг. XV в. племена Семиречья вошли в состав Казахского ханства