Диагностика и профилактика инфекционных болезней на современном этапе
жүктеу/скачать 4,14 Mb. Pdf көрінісі
|
diagnostika
| Материалы и методы.
Ретроспективный эпидемиологический анализ заболеваемости ГЛПС в Еврейской АО проведен на основе архивных литературных, статистических данных и материалов, поступающих из учреждений Роспотребнадзора Еврейской АО в Референс-центр по мониторингу возбудителей природно-очаговых инфекционных болезней Иркутского научно-исследовательского противочумного института Сибири и Дальнего Востока. Учет численности и отлов мелких млекопи- тающих осуществляли в июле 2015 г. в природных и антропургических биотопах Биробиджанского и Ленинского районов. Всего было отработано 400 ловушко-суток. Добыто 90 и исследовано 63 особи мелких млекопитающих семи видов. Выявление РНК хантавирусов осуществляли с использованием метода ОТ-ПЦР. Тотальное выде- ление РНК хантавирусов проводили набором «Рибозоль-В» в соответствии с инструкцией произво- дителя (ЦНИИ эпидемиологии, Москва). Получение кДНК хантавирусов на матрице РНК осущест- вляли набором реагентов «Реверта-L» (ЦНИИ эпидемиологии, Москва). Технология генотипирования включала ПЦР с использованием набора праймеров, кодирующих L-фрагмент генома хантавирусов и последующим учетом результатов методом общепринятой электрофоретической детекции в агароз- 19 ном геле, прямое секвенирование ампликонов положительных образцов. Для секвенирования исполь- зовали набор «Big Dye Terminator Cycle Sequencing Kit v1.1» и автоматический анализатор Applied Biosystem 3500 xL. Обработку нуклеотидных последовательностей проводили с помощью программы BioEdit V.7.0.9., филогенетический анализ – с применением программы Mega 5.0. Для подтверждения таксономической принадлежности мелких млекопитающих, от которых выделена РНК хантавирусов, было проведено определение и сравнительный анализ с базой данных GenBank последовательностей фрагмента митохондриальной ДНК (D-loop). жүктеу/скачать 4,14 Mb. Достарыңызбен бөлісу:
|