Сонымен бірге әдістемелік жұмыста шешілмеген мәселелер бар:
Оқушылардың қабілеті мен дайындығына қарамастан олардың танымдық әсерін қамтамасыз ететін әдіс-амалдарды сабақтарда барлық мұғалімдер пайдалана бермейді (көрнекі-құралдар, өмірмен байланысты, өздігінен танымдық шығармашылық қызметін танытатын тапсырмалар және т.б.),.
Сабақта оқушылардың оқу материалын толықтай игеруді қамтамасыз ететін, танымдық қызметі, ойлау жүйесін дамытуды ұйымдастыру түрі табылған жоқ. Ол материалын дайындауына және оқу әдісіне сәйкес таңдауына байланысты болып табылады.
Тәрбиелеу және дамыту, эмоционалды көңіл-күйін көтеру мен оқу бірлестігін қамтамасыз ету, тақырып бойынша оқушылардың танымдық қызығушылығын оятып, оқу мотивациясын қалыптастыру бойынша педагогикалық ұжым жұмысы тиімсіз болып тұр.
Әдістемелік жұмыстың дәстүрлі емес формасының жаңашылдықтарын ізденуге, басқа да жұмыс түрлерін табуға мұғалімдердің толық қамтымауы және т.б..
Мұғалімдердің өзара талдау және оқушылардың өзара бақылау деңгейі жоғары емес.