Алкогольді қолданған кезде Орталық Жүйке Жүйесіндегі зат алмасу үрдісін бұзады.Алкоголь ГАМК жүйесінің қызметіне және N – метил- Д-аспарагин қышқылына әсер етеді. ГАМК – нейротрансмиттер, сыртқы сигналдарға нейронның сезімталдығын төмендетеді. Бір реттік қолданылған алкоголь ГАМК-рецепторының белсенділігін жоғарылатады, созылмалы алкогольді интоксикация сезімталдықтың төмендеуіне және Орталық Жүйке Жүйесіндегі ГАМК деңгейінің төмендеуіне әкеледі. Орталық Жүйке Жүйесіндегі негізгі қозушы нейротрансмиттерге –глутамат. Жүйке жүйесінің қозуына N – метил- Д-аспарагин қышқылының әсер етуі, тырыспаларға әкелуі мүмкін. Бір реттік қолданылған алкоголь N – метил- Д-аспарагин қышқылының рецепторының белсенділігін ингибирлейді,ал этанолды жалпылай қолданғанда жоғарылайды. Алкогольді АС дофамин,эндорфин,серотонин,ацетилхолин алмасуына әсер етеді.