При эозинофильном гастроэнтерите чаще поражаются и желудок, и тонкая кишка.
Клинически заболевание может манифестировать болями в животе, тошнотой, рвотой, может быть диарея, анемия, симптомы мальабсорбции. Очень характерна экссудативная энтеропатия, гипопротеинемия, могут быть отеки.
Эндоскопическая картина желудка и тонкой кишки чаще нормальная, но может наблюдаться гиперплазия лимфоидных фолликулов, реже – эрозии и язвы. Видеокапсульная эндоскопия - по ходу тонкой кишки участки гиперемии, утраты ворсин, ульцерации, неполные стриктуры.