Екі хандықтың арасында бірлік сақталмады, ИбраҺим ибн Насыр ХІ ғ. 40ж-да Әли тегінің балаларының қарсы күресте жеңіп шығады.Ол 1040 ж. «Бурахан» атағын алады, Мауаранахрға өз үстемдігін орнатты. 1040 ж (ХІ ғ.40ж) мемлекет екіге бөлінді Шығыс (942-1212) Территориясы -Жетісу,Шығ.Түркістан Орталығы-Баласағұн немесе Күз Орда (999-1212) Территориясы -МауараннахрОрталығы-Үзкент кейін-Самарқан 1089 жылы Батыс хандығының орталығы Самарқандты одан сон Бұхараны Салжұқ 1125 ж –Елюий Дашибастаған қарақытайлар басып кірі. Вассал есебінде қалды. ХІІғ30ж. -Шығыстан қарақытайлар Жетісуға басып кірді. 1212ж- найман ханы Күшілікбасып алады. султаны Мәлік шах басып алды. Қарахан мемлекетін өз васалына айналдырды. 1141 жылы Самарқан қаласында жақын жерде Қатуан даласында Салжұқтармен Қарахан әскерлерін қарақытайлар ойсырата жеңді. 1141- 1212 дейінқарақытайларға бағынышты болды. 1212 жылы Хорезм шахы Мұхаммед жаулап алды Шаруашылығы Тараз,Баласағұн,Талғар ірі қалалардың маңында отырықшы халық егін,бау-бақша дамыды. Далалы,таулы, қыратты жерлерде-жартылай көшпелі жартылай отырықшы мал шаруашылығымен айналасты. Аралас түрімен-Оңт.Қаз,Шығ.Түркістан. «Түріктер жылқы малын көп өсірді» деп айтқан Жүсіп Баласағұн.
