Жоғарғы тыныс жолына шаң бөлшектерімен бірге микробтар түсіп оның көпшілігі мұрын және ауыз-жұтқыншықта өледі.Мұнда бактероидтар,коринеформды бактериялар, гемофилді таяқшалар, лактобактериялар,стафилококктар, стрептококктар,нейссериялар, пептококктар, пептострептококктар және альвеолалар болады
Дені сау ағзаның көмей, кеңірдек,бронхтар мен альвеолаларының шырышты қабаттарында микроорганизмдер болмайды.Ауыз бен мұрын, жұтқыншақ микрофлорасының негізгі массасын жасыл стрептококтар,аздап нейссерлер, дифтероидтар мен стафилококктар құрайды.