Генерализация инфекции сопровождается проникновением микробов в канальцы и клубочки почек: развивается гломерулонефрит. В результате инфицирования нередко формируются участки некроза слизистой оболочки и абсцессы почек. Эпителий канальцев может подвергнуться деструкции. Отторжение погибших клеток эпителия вызывает обтурацию просвета канальцев клеточным детритом.
Указанные изменения обусловливают нарушение процессов фильтрации, реабсорбции и секреции.
Острое течение процесса чревато развитием острой почечной недостаточности, длительное - хронической почечной недостаточности, нефросклероза, артериальной гипертензии.