Сараптама бөлімшелері орталық аткарушы органның мемлекеттік экологиялық сараптама органының және оның жергілікті жерлердегі органдары жанында болады. Сараптама бөлімшелерінің басшылары экологиялық сараптаманы ұйымдастыру мен жүргізу кезінде тәуелсіз болады және өзінің қызметінде ҚР-ның қолданыстағы заңын басшылыққа алады. ҚР-ның «Экологиялық сараптама туралы» Заңы мынадай:
экологиялық-сараптама комиссияларын, және топтарын өзге де құрылыңдарды құруга, шарт негізінде олардың жұмысына қатысуға, жоғары білікті отандық, шетелдік мамандар мен ғалымдарды
заңды тұлғаларды тартуға;
