5. Конфокалды микроскоп. Сканерлейтін электронды микроскоптың жасағанына сәйкес, конфокальды микроскоп - бұл флуоресцентті микроскоптың бір түрі, онда барлық үлгі жарықтандырылмайды, керісінше сканерлеу жасалады. Дәстүрлі флуоресценциядан артықшылығы-конфокальды микроскоп үш өлшемді кескін алу үшін үлгіні қалпына келтіруге мүмкіндік береді.
6. Туннельдік микроскоп. Туннельдік эффектілі микроскоп бөлшектердің атомдық құрылымын бейнелеуге мүмкіндік береді. Кванттық механиканың принциптерін қолдана отырып, бұл микроскоптар электрондарды түсіреді және әрбір атомды бір-бірінен ажыратуға болатын жоғары ажыратымдылықтағы кескінге қол жеткізеді. Бұл нанотехнология саласындағы маңызды құрал. Оларды заттардың молекулалық құрамының өзгеруіне және үшөлшемді суреттер алуға мүмкіндік беру үшін пайдалануға болады.