БІЛІМ ЖӘНЕ ҒЫЛЫМ МИНИСТРЛІГІ ҚАЗАҚСТАН РЕСПУБЛИКАСЫ Қазақ Ұлттық Аграрлық Зерттеу Университеті
Реферат
Тақырыбы: ДНҚ маркердің молекулярлық салмағы
Орындаған: Қабылдаған:
Жоспары І. Кіріспе
ІІ. Негізгі бөлім
2.1. ДНҚ маркер деген не?
2.2. ДНҚ мөлшері мен салмақ маркерлері
2.3. ДНҚ зонының маркерлері
ІІІ. Қорытынды
Пайдаланылған әдебиеттер тізімі
Кіріспе Мал шаруашылығының дамуы әрқашан жануарлардың әр түрлі өндірістік көрсеткіштерін жақсартуға деген ұмтылыспен байланысты болды, әдетте, фенотиптік параметрлер бойынша, қарабайыр деңгейде жүзеге асырылды. Конформдық сипаттамалары керемет жануарлардың ұрпақтары да жоғары өнімділік көрсеткіштеріне ие болады деп сенген. «Алма алма ағашынан алыс емес» деген ой ішінара шындыққа сәйкес келді, ол сол деп аталатын деп аталған. «Халықтық селекция» тұқымдары және жануарлардың түрлері.
Екінші жағынан, әртүрлі дәуірлерде және мал шаруашылығының әртүрлі салаларында «идеал» жануардың басымдылық параметрлері түбегейлі, кейде диаметрлі түрде әр түрлі болды, бұл зерттеушілердің әрекеттерін табандылыққа айналдырмады. Шамамен екі ғасыр бұрын адамның шаруашылық қызметін жүзеге асыру үшін маңызды жануарлардың әр түрлі өндірістік көрсеткіштерінің ішінен негізгілері тұрақты қалыптасты: жылқы шаруашылығындағы ептілік пен төзімділік, ірі қара мал өсіруде сүттің көптігі және тірі салмақ, шошқадағы ет мөлшері асылдандыру, қой өсірудегі жүннің саны мен сапасы, сүтті ешкі өсіруде сүт өндіру, құс өсіруде жұмыртқа өндіру. Ғалымдардың зерттеулері мен практиктердің күш-жігері негізінен осы ерекшеліктерді дамытуға және жақсартуға бағытталды. Кейінірек, жалпы биологияда білім жинақталып, содан кейін генетиканың қарқынды дамуы кезінде жануарлардың белгілі фенотиптік параметрлері мен өнімділік қасиеттерін сипаттайтын ішкі көрсеткіштерді табуға бағытталған зерттеулер барған сайын танымал бола бастады. Атап айтқанда, 1923 жылы «Генетика» журналы мақала жариялады, онда автор бұршақ тұқымының мөлшері (сандық белгі) мен тұқым қабығының пигментациясы (сапалық белгі) ассоциациясы туралы деректерді келтірді. Осылайша, сандық (сыртқы) белгілерге әсер ететін генетикалық (ішкі) факторларды маркерлік белгінің көмегімен қалай анықтауға болатындығы бірінші рет көрсетілді. 1926 жылы акад. А.С. Серебровский мен Е.Т. Васин-Попова тауықтың жыныстық хромосомасында гендердің орналасуын сипаттады. Сонымен бірге А.С. Серебровский жұмыртқа өндірісін анықтайтын генді іздеу үшін қолданылған «сигналдық ген» әдісін ұсынды.
Өткен ғасырдың соңғы екі онжылдығы байланыстыру карталарын құру және сандық белгілердің осы жерлерін іздеу кезеңі болып саналады. Кейіннен молекулалық биология әдістерінің жетілдірілуі және іргелі білімнің жинақталуы сапалы секіріске әкелді - полимеразды тізбек реакциясы (ПТР) негізінде салыстырмалы түрде қарапайым және арзан әдіс пайда болды. Басқаша айтқанда, әртүрлі организмдердің ДНҚ-сына тікелей зерттеу жүргізуге мүмкіндік беретін маркер жүйелері құрылды. ДНҚ маркерлері - бұл функциялары белгісіз, бірақ хромосомада белгілі позициясы бар ДНҚ-ның полиморфты аймақтары. ДНҚ маркерлерінің артықшылығы - ДНҚ тізбегіндегі өзгерістер денеде болатын барлық кейінгі өзгерістердің негізгі себебі болып табылады. Сонымен қатар, олар бүкіл геномның 1-ден 10% дейін құрайтын ақуызды кодтайтын тізбектерді ғана емес, кез-келген геномдар тізбегін талдауға мүмкіндік береді. Жаңа технология Genomic Selection (GS) деп аталады.
Бұрын зерттеушілер жас жануардың генетикалық потенциалы туралы білетіндердің бәрі оның ата-аналарының орташа деңгейінен шыққан. Бұл сандар жануарлардың ата-аналарының болжамды тарату қабілеттілігінің (PTA) орташа мәні болды, ал ғалымдарда жас жануардың қандай гендер тұқым қуалағанын анықтай алмады: осы орташадан жақсы немесе нашар. Мысалы, мал шаруашылығында сиырдың лактация параметрлері анықталғанға дейін екі жыл күте тұрудан басқа таңдау болмады. Бұқалар туралы айтатын болсақ, олардың қыздары емізуді бастауы үшін бес жыл қажет болады. Енді, жануарлардың ата-бабаларында байқалған нуклеотидтік реттік маркерлер мен функционалды маңызды гендер арасындағы байланыстар бірнеше ұрпақ бойы сақталатындықтан (олар рекомбинация арқылы үзілгенге дейін), ғалымдар жас жануардың болашағына ақырында көз жүгірте алады. ДНҚ нуклеотидтер тізбегінің полиморфизмі ДНҚ маркерлерінің кез-келген түрін жасауға ықпал етеді. Секвенирлеу әдістерін жетілдіру және автоматтандыру (нуклеотидтер ретін декодтау) арқылы мыңдаған маркерлер үшін жануарларды генотиптеу мүмкін болды. Бірыңғай нуклеотидтік полиморфизмге (SNP) негізделген «микрочипті» (бірнеше ондаған үлгілерде он мыңдаған гендердің экспрессиясының арнайы платформасында бір уақытта талдау) қолдану тиімді технология болып саналады. ДНҚ тізбегіндегі нүктелік мутацияны (A, T, C немесе G) білдіретін бір нуклеотидті полиморфизм маркерлерін, мысалы, бұрын дәйекті түрде қолданылған (бір-бірден) микроспутниктік маркерлерге қарағанда әлдеқайда тиімді және аз еңбекпен зерттеуге болады. Microarray технологиясы геном бойынша біркелкі таратылған маркерлер шығарады. Бұл маркерлер кез-келген популяцияға сәйкес (жарамды) болуы мүмкін әр түрлі QTL байланыстары мен байланыстарын анықтау үшін адам мен жануарлардың геномында интенсивті түрде зерттеледі. Осылайша, GS геномдық тұқымның жалпы құндылығын (TGBV) бағалауға және оны жануарларды іріктеу кезінде қолдануға сілтеме жасайды.