Құрылым файлын алу үшін қандай әрекеттерді орындау керек



Дата17.01.2023
өлшемі12,69 Kb.
#165728
Байланысты:
СОӨЖ Биоинформатика (1)
tests052011, Жоба биостат 3 топ 3-021ЖМ[1], бх, Анеля, срсп, кожантаева аллахвердиева баранкова 3027 ом, тема 1, ФОРМУЛА ТАБЛИЦА

ӨЗІНДІК ЖҰМЫС
1. NCBI сайтын пайдаланып, қарау бағдарламаларының бірінде көруге жарамды, құрылым файлын алу үшін қандай әрекеттерді орындау керек ( Download түймесін басқаннан кейін 1-Тапсырманы қараңыз)?

2. rcsb.org сайт құрылымы бетіндегі Structure summary (құрылымдар жиынтығы) және Sequence (Секвенция) қойындыларында қандай ақпарат бар? Нақты деректер мен параметрлерді тізімдеңіз.

3. HELIX, SHEET, ATOM, HETATM PDB файлының бөлімдерінде қандай ақпарат бар? Тиісті жолдардың құрылымын мүмкіндігінше толық сипаттауға тырысыңыз.

Jsmol сервис интерфейсін зерттеу нәтижелері бойынша:


1. Практикалық тапсырмада көрсетілген командалардың әрқайсысы қандай әрекетті орындайтынын сипаттаңыз
2. SMILES форматында кез-келген амин қышқылының (АЛАНИННЕН басқа) жазбасын жасаңыз және оны Smol көмегімен көрсетіңіз.
3. 2R33 құрылымының N-соңғы бөлігінде қанша аминқышқылының қалдықтары жоқ?
4. 2R33 құрылымында дисульфидті байланыстардың түзілуіне қатысатын цистеин қалдықтарын тізімдеңіз. Полипептидтік тізбектің N-соңғы бөлігі құрылымда болмауы мүмкін екенін ескере отырып, қалдықтардың дұрыс нөмірлерін көрсетіңіз.

Достарыңызбен бөлісу:




©engime.org 2024
әкімшілігінің қараңыз

    Басты бет