Органы дыхания представлены жабрами -ктенидиями различного строения (рис.117). Жабры примитивных первичножаберных двухстворчатыхмоллюсков (Protobranchia) в виде пары типичных ктенидиев с перистыми лепестками. У собственно жаберных двустворчатых моллюсков (Autobranchia) жабры бывают нитевидными или пластинчатыми. У нитевидных жабр мидий, устриц и гребешков жаберные лепестки удлинены в нити и спадают в нижнюю часть мантийной полости. При этом соседние нити скрепляются друг с другом с помощью жестких ресничек, образуя пластинки. Еще более сложно устроенных пластинчатых жабр, представляющих дальнейшей модификацией нитевидных жабер, возникают поперечные перегородки между восходящими и нисходящими участками нитей и между соседними нитями. В результате образуется жаберные пластинки. Каждая жабра состоит из наружной и внутренней пластинок - полужабр. Наружняя полужабра прилегает к мантии, а внутренняя жабра - к ноге. Такие жабры характерны для беззубок, перловиц. У перегородчато-жаберных моллюсков (Septibranchia) жабры преобразованы в жаберную перегородку с порами. Перегородка отгораживает верхнюю часть мантийной полости, выполняющую дыхательную функцию. Стенки этой дыхательной полости имеют густую сеть кровеносных сосудов, где происходит газообмен.