Возможна вариабельность качества данных оценки воздействующего фактора.
Может быть более высокая предрасположенность к систематическим ошибкам по сравнению с когортными исследованиями и другими особенностями исследований такого типа.
Отсутствует информация о частоте развития болезней и временных тенденциях.
Возможность отсутствия репрезентативности исследуемых популяций (например, для лиц, менее способных к передвижению), что приводит к прекращению их наблюдения.