Биоинформатика - биологиялық деректерді сақтау, жинау, ұйымдастыру және талдау үшін әдістерді дамытып, кемелдендіретін пәнаралық сала.
Биоинформатиканың әдiстері мен тәсілдік жиынтықтары:
Салыстырмалы геномикада (гендiк биоинформатика) компьютер талдауының математикалық әдiстерi.
Алгоритмдарды әзiрлеу және (құрылымдық биоинформатика) ақуыздарды кеңiстiктiң құрылымын болжау үшiн керекті бағдарлама.
Стратегиялар, тиiстi есептеуiш методологийлердi зерттеу, сонымен бiрге биологиялық жүйелердi ақпараттық күрделiлiктiң ортақ басқару
Биоинформатикалық деректер. Түрлері. Ерекшеліктері
Биоинформатикалық деректерге не жатады?
Тізбектік талдау
Геномдық аннотация
Есептік эволюциялық биология
ДНҚ секвенциясы
Салыстырмалы геномика
Генетикалық код
Тізбектік талдау
Бұл реттілік туралы ақпарат кодтайтын гендерді анықтау үшін талданады белоктар, РНҚ гендері, реттеуші реттіліктер, құрылымдық мотивтер және қайталанатын тізбектер. ДНҚ тізбектері мыңдаған организмдер декодталған және мәліметтер базасында сақталған.
Геномдық аннотация
Геномдық аннотация – бұл гендер мен басқа биологиялық ерекшеліктерді ДНҚ тізбегінде белгілеу процесі. Бұл процесті автоматтандыру қажет, өйткені геномдардың көпшілігі қолмен аннотация жасау үшін өте үлкен, өйткені геномға мүмкіндігінше көбірек аннотация жасауға ұмтылыс туралы айтпағанда реттілік тығырықтан шығуды доғарды. Аннотация гендердің танылатын және басталатын аймақтарына ие болуымен мүмкін болады, дегенмен бұл аймақтарда кездесетін нақты дәйектілік гендер арасында әр түрлі болуы мүмкін.
Геномдық аннотация визуализациясы
Есептік эволюциялық биология
Эволюциялық биология шығу тегі мен шығу тегі туралы ілім болып табылады түрлері, сонымен қатар олардың уақыт бойынша өзгеруі. Информатика зерттеушілерге мүмкіндік бере отырып, эволюциялық биологтарға көмектесті:
көптеген организмдердің өзгеруін өлшеу арқылы олардың эволюциясын қадағалау
толығымен салыстыру геномдар сияқты күрделі эволюциялық оқиғаларды зерттеуге мүмкіндік береді, гендердің қайталануы, геннің көлденең трансферті және бактериалды маңызды факторларды болжау спецификация
күрделі есептеу құруға популяция генетикасы жүйенің уақыт бойынша нәтижесін болжауға арналған модельдер
түрлер мен ағзалардың саны артып келе жатқандығы туралы ақпаратпен бөлісу және бөлісу
ДНҚ секвенциясы
ДНҚ-ны секвенирлеу әдістерінің көпшілігі геннің немесе геномның толық тізбегін алу үшін жинақталуы керек қысқа тізбектің фрагменттерін жасайды.
Биоинформатикадағы ең басты мәселелердің бірі бұл секвенирлеу арқылы аса көп мөлшерде түсетін ақпаратты өндеу.
Салыстырмалы геномика
Салыстырмалы геномды талдаудың өзегі – гендер арасындағы сәйкестікті орнату (орфология талдау) немесе әр түрлі организмдердегі басқа геномдық ерекшеліктерін анықтау. Дәл осы геногендік карталар екі геномның дивергенциясына жауап беретін эволюциялық процестерді бақылауға мүмкіндік береді. Әр түрлі ұйымдастырушылық деңгейде әрекет ететін көптеген эволюциялық оқиғалар геном эволюциясын қалыптастырады.
Генетикалық код Генетикалық код — тірі организмдерге тән нуклеин қышқылдары молекуласындағы тұқым қуалаушы (генетикалық) ақпараттың нуклеотидтер тізбегі түріндегі біртұтас “жазылу” жүйесі. Бұл — барлық тірі организмдерге ортақ заңдылық.