Биоинформатика және


Үлкен геномдық тізбектерді теңдестіру



бет6/21
Дата19.03.2022
өлшемі5,26 Mb.
#136189
1   2   3   4   5   6   7   8   9   ...   21
Байланысты:
Все лек

Үлкен геномдық тізбектерді теңдестіру


    • Екі тізбек арасындағы өте ұқсас аймақтарды табу

    • Ұқсастық, қайта ұйымдастыру және т.б. бөлшектеруге мүмкіндік

Мәселелер:

  • Қиын процесс

  • Масштабтылық, көптеген геномдық тізбіктер анықталуда

  • Уақыт шектеулігі




Теңдестіру стратегиясы





    • Барлық кодтайтын экзондарды қолданыңыз

    • Ең жақсы кері попадание кешенін алыңыз

    • Ортологтар картасын құрастырыңыз

    • Мульти жаһандық теңдестіру құрастырыңыз





PhD докторы Коразбекова К.У.,




Синтетикалық аймақтар



    • Геномдық теңдестіру үлкен синтетикалық аймақтардан тұрады

    • Теңдестірулер берге кластерленеді, егер олардың арасындағы

қашықтық 100 кб аз, реттілік және бағыт берік болса

    • 100 кб аз кез-келген кластерлер жасалынбайды






Достарыңызбен бөлісу:
1   2   3   4   5   6   7   8   9   ...   21




©engime.org 2024
әкімшілігінің қараңыз

    Басты бет