Үлкен геномдық тізбектерді теңдестіру

Үлкен геномдық тізбектерді теңдестіру

• 
  Екі тізбек арасындағы өте ұқсас аймақтарды табу
  
• 
  Ұқсастық, қайта ұйымдастыру және т.б. бөлшектеруге мүмкіндік
  

• 
  Қиын процесс
  
• 
  Масштабтылық, көптеген геномдық тізбіктер анықталуда
  
• 
  Уақыт шектеулігі
  

Теңдестіру стратегиясы

• 
  Барлық кодтайтын экзондарды қолданыңыз
  
• 
  Ең жақсы кері попадание кешенін алыңыз
  
• 
  Ортологтар картасын құрастырыңыз
  
• 
  Мульти жаһандық теңдестіру құрастырыңыз
  

PhD докторы Коразбекова К.У.,

Синтетикалық аймақтар

• 
  Геномдық теңдестіру үлкен синтетикалық аймақтардан тұрады
  
• 
  Теңдестірулер берге кластерленеді, егер олардың арасындағы
  

қашықтық 100 кб аз, реттілік және бағыт берік болса

• 
  100 кб аз кез-келген кластерлер жасалынбайды
  

жүктеу/скачать 5,26 Mb.

Достарыңызбен бөлісу: