Обоснованность данных может относиться только к изучаемой популяции с ограниченной значимостью для реальной практики
Используемые косвенные, или «суррогатные», показатели могут не иметь связи с соответствующими клиническими исходами
Требуют больших финансовых затрат: высокая стоимость может обусловливать планирование исследования с недостаточным объемом выборки
Требуют больших затрат времени: исследование может быть завершено после внедрения в практику новых медицинских продуктов или методов лечения, так что в исследовании могут изучать реально уже не применяемые средства
Неприменимы для оценки подходов к лечению больных, требующих неотложной помощи, и для лечения определенных заболеваний (например, редких)
Могут не учитывать влияние на другие популяции (например, на больных, которые не участвуют в исследовании, как это может иметь место при распространении инфекции на других лиц)
Обоснованность ограничена качеством включенных в анализ исследований и различными методами оценки одних и тех же исходов в разных исследованиях
Возможность создания ложного впечатления о точности результатов
Учитывая простоту проверки многих гипотез, имеется возможность систематической ошибки, связанной с преимущественным опубликованием результатов исследований с положительным результатом
В некоторых областях ограниченная доступность обоснованных исследований
