Осылайша, бөлімдер 1941 жылы орталық мемлекеттік тарихи мұрағатқа және Октябрь революциясының орталық мемлекеттік мұрағатына айналды. 1943 жылы ҚФФ ОМО құрылады, олар 50-жылдардың соңында құрылымдық жағынан қайта құрылады және Қаз бірыңғай ОМО құрады.КСР.
Қазақ КСР мұрағат ісі 1950-60-70 жж.
Соғыс жылдары КСРО мұрағат мекемелері мұрағаттарды жинақтау, құжаттардың сақталуын қамтамасыз ету, жариялау бойынша жұмыстарды жалғастырды. Соғыс қимылдарының басында Батыс өңірінің мұрағаттары Сібірге, Қазақ ССР-не және басқа республикаларға көшірілді. Қазақ КСР-не барлығы 16-дан астам Мұрағат вагондары шығарылды, олар облыстық мемлекеттік мұрағаттарда және кейбір қалаларда, қалалық мұрағат бөлімдерінде шоғырланған. Бейімделген үй-жайлардың болмауына байланысты көптеген құжаттар ылғалдан жойылды, олардан ақпаратты қалпына келтіру мүмкін болмады. Дегенмен, қиын жағдайларға қарамастан, мұрағат қызметінің барлық бағыттары бойынша жұмыс жалғасуда. Сонымен қатар, соғыс жылдарында, дәлірек айтсақ, 1943 жылдың қаңтарында Алматыда Орталық мемлекеттік киноқұжаттар мен дыбыс жазбалары мұрағаты құрылды.
