Осуществляя свою паразитическую функцию, хламидии подавляют, но сохраняют определенный уровень жизнеспособности хозяина до завершения цикла своего развития. Исключение составляет явление "немедленной токсичности».
Под влиянием антибактериальных препаратов (пенициллин и др.) в инфицированной клетке появляются аномальные формы хламидий морфологически сходные с L-формами бактерий, способные к реверсии при удалении действующего агента.
Такие формы могут персистировать в клетке на протяжении ее жизненного цикла и передаваться дочерней клетке вместе с включением, продолжая синтезировать белок теплового шока, который играет важную роль в патогенезе.