152
Таблица 1 – Температурный режим реакции
Стадия 1
94
о
С
2 мин.
1 цикл
Стадия 2
98
о
С-58
о
С-68
о
С
10 сек.- 30 сек.- 30 сек.
35 циклов
Стадия 3
68
о
С
7 мин.
1 цикл
Полноразмерную к ДНК
IbCBF3
получали путем ПЦР из тотальной РНК, выделенной
из
сладкого картофеля, с использованием специфической пары праймеров
IbCBF3
.
Продукты ПЦР очищали и первоначально клонировали в T-blunt вектор (BioFACT, Daejeon,
Корея) и секвенировали. Для генерации конструкции SWPA2::
IbCBF3
полноразмерная к
ДНК
IbCBF3
встраивалась в плазмиду pCAMBIA2300
под индуцибелным промотером
SWPA2. Лигирование проводилось согласно инструкции компаний DiaStar Quick DNA
Ligase, Korea.
Результаты исследований и их обсуждение
Для получения исследуемых генов была выделена
тотальная РНК сладкого
картофеля при помощи реагента TRIzol по стандартному протоколу,
далле была
снтезирована кДНК с использованием готового микса TopScript™ RT DryMIX (dT18)
(Enzynomic, Daejeon, Корея) в соответствии с инструкцией производителя. Используя базу
данных
NCBI
(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/),
Мичиганского
университета
(http://sweetpotato.plantbiology.msu.edu/) и из KRIBB (Корейского Института Биологии и
Биотехнологии) были составлены специфические праймера для изучаемых генов.
Затем был выделен вышеуказанный ген (Рисунок 1), определена его длинна (
IbCBF3
– 786bp) и ген был клонирован в T-blunt™ вектор. Набор для клонирования T-Blunt ™
PCR обеспечивает жизнеспособную систему отбора, которая
выращивается только во
встроенной колонии путем автоматического вымирания самолигированного клона из-за
гена ccdB вектора T-Blunt ™. Затем был проведен полный секвенс выделенного гена
компанией Genotech (www.genotech.co.kr) и проведен сравнительный
анализ данных с
базами NCBI применяя программу BioEdit.
Рис
.1 – Электрофорез гена
IbCBF3
после ПЦР
Выделенный ген
IbСBF3
был клонирован в тело агробактериального бинарного
вектора pCAMBIA2300 с индуцибельным промотором SWPA2.
Промотор был
предоставлен профессором С.С.Кваком (KRIBB, Корея) (рисунок 2) [10]. Наличие вставок
было проверено методом ПЦР анализа и сиквенсом.
При разработке эффективной системы экспрессии важно выбрать подходящий
промотор. Промотер SWPA2 индуцирует более высокие уровни экспрессии экзогенного
гена, чем промотор 35S, мозаичного вируса цветной капусты (CaMV 35S) в
ответ на
различные стрессовые обработки, так же он был успешно
применен для получения
трансгенных растений, тополь, картофель и рис [11,12,13]. Индуцируемый стрессом
промотор SWPA2 очень подходит для создания трансгенных
растений с повышенной
устойчивостью к стрессам окружающей среды.