Issn 2072-0297 Молодой учёный Международный научный журнал Выходит еженедельно №3 (137) / 2017 р е д а к ц и о н н а я к о л л е г и я : Главный редактор


Характеристики контигов для оптимального значения k — мера



Pdf көрінісі
бет40/129
Дата23.11.2022
өлшемі9,13 Mb.
#159594
1   ...   36   37   38   39   40   41   42   43   ...   129
Байланысты:
moluch 137 ch1

 Характеристики контигов для оптимального значения k — мера
Длина 
k-мера
Количество 
контигов
Максимальная длина 
контига
Минимальная длина кон-
тига
Средняя длина кон-
тига
26
12809
11454
1602
6398
Время работы сборщика составило 452 минуты, из ко-
торых 22 минут заняло построение графа, 2 минут постро-
ение сжатого графа, и 428 минут сборка контигов. Необ-
ходимо отметить, что предложенный алгоритм является 
только частью процесса сборки геномной последователь-
ности и полученные фрагменты нуждаются в дальнейшей 
обработке.
Заключение
В результате работы был разработан прототип сбор-
щика, основанный на графе де Брёйна, который в пер-
спективе позволит справиться с проблемой повторов 
в больших геномах. В будущем планируется, во-первых — 
переписать сборщик на более быстрый язык, например 
C++, во-вторых — использовать в его работе техно-
логию параллельных вычислений CUDA.
Литература:
1. Illumina [Электронный ресурс]: официальный сайт компании // Режим доступа: http://www.illumina.com/.
2. Butler, J. Allpaths: de Novo assembly of whole-genome shotgun microreads / J. Butler. — Genome Research, 
2008. — 496p.
3. Daniel, R. Velvet: Algorithms for de Novo short read assembly using de bruijn graphs. Genome Research / R. Daniel. — 
Lecture Notes Comput., 2008. — 554p.
«Паутина в паутине»: интернет-мошенничество
Глебова Ксения Владимировна, студент;
Воробьев Кирилл Викторович, студент
Орловский государственный аграрный университет имени Н. В. Парахина
Н
а сегодняшний день желающих заработать быстро 
и в тоже время без каких-либо усилий весьма значи-
тельно. Говоря о повседневной жизни, следует отметить, на-
пример, наличие огромного количества магазинов-дублеров, 
внешне похожих по ассортименту товаров, и по названию 
(«Магнит», «Манит», «Магнат»). Они имеют очень близкое 
внешнее оформление, но, как правило различаются по попу-
лярности — один является признанным брэндом, другие — 
малоизвестны. Кроме таких «подмен», существуют и другие 
виды, гораздо более «черного» мошенничества.
Мошенники действуют практически в каждой сфере 
деятельности, но с приходом в жизнь человека различных 


“Young Scientist”


Достарыңызбен бөлісу:
1   ...   36   37   38   39   40   41   42   43   ...   129




©engime.org 2024
әкімшілігінің қараңыз

    Басты бет