Характеристики контигов для оптимального значения k — мера
Длина
k-мера
Количество
контигов
Максимальная длина
контига
Минимальная длина кон-
тига
Средняя длина кон-
тига
26
12809
11454
1602
6398
Время работы сборщика составило 452 минуты, из ко-
торых 22 минут заняло построение графа, 2 минут постро-
ение сжатого графа, и 428 минут сборка контигов. Необ-
ходимо отметить, что предложенный алгоритм является
только частью процесса сборки геномной последователь-
ности и полученные фрагменты нуждаются в дальнейшей
обработке.
Заключение
В результате работы был разработан прототип сбор-
щика, основанный на графе де Брёйна, который в пер-
спективе позволит справиться с проблемой повторов
в больших геномах. В будущем планируется, во-первых —
переписать сборщик на более быстрый язык, например
C++, во-вторых — использовать в его работе техно-
логию параллельных вычислений CUDA.
Литература:
1. Illumina [Электронный ресурс]: официальный сайт компании // Режим доступа: http://www.illumina.com/.
2. Butler, J. Allpaths: de Novo assembly of whole-genome shotgun microreads / J. Butler. — Genome Research,
2008. — 496p.
3. Daniel, R. Velvet: Algorithms for de Novo short read assembly using de bruijn graphs. Genome Research / R. Daniel. —
Lecture Notes Comput., 2008. — 554p.
«Паутина в паутине»: интернет-мошенничество
Глебова Ксения Владимировна, студент;
Воробьев Кирилл Викторович, студент
Орловский государственный аграрный университет имени Н. В. Парахина
Н
а сегодняшний день желающих заработать быстро
и в тоже время без каких-либо усилий весьма значи-
тельно. Говоря о повседневной жизни, следует отметить, на-
пример, наличие огромного количества магазинов-дублеров,
внешне похожих по ассортименту товаров, и по названию
(«Магнит», «Манит», «Магнат»). Они имеют очень близкое
внешнее оформление, но, как правило различаются по попу-
лярности — один является признанным брэндом, другие —
малоизвестны. Кроме таких «подмен», существуют и другие
виды, гораздо более «черного» мошенничества.
Мошенники действуют практически в каждой сфере
деятельности, но с приходом в жизнь человека различных
“Young Scientist”
Достарыңызбен бөлісу: |
