Органы выделения. Почки двустворчатых моллюсков с железистыми стенками называют боянусовыми органами. Они имеют V-образную форму и одним концом открываются в перикард, а другим — в мантийную полость. Выделительную функцию выполняет и кеберов орган - видоизмененная в виде парных желез стенка перикарда.
Нервная система упрощена в сравнении с брюхоногими моллюсками. В связи с редукцией глотки церебральные ганглии слились с плевральными ганглиями и образовались цереброплевральные ганглии. В ноге имеются педальные ганглии, связанные с коннективами с первой парой узлов. В заднем конце тела, под мускулом-замыкателем располагается висцеро-париетальные ганглии, иннервирующие внутренние органы, жабры и осфрадии.
Органы чувствразвиты слабо. В ноге имеются статоцисты - органы равновесия, иннервируемые церебральными ганглиями. У основания жабер находятся осфрадии — органы химического чувства. Рецепторные клетки располагаются на жабрах, ротовых лопастях, краях мантии и на сифонах. У некоторых видов по краю мантии (гребешок) или на сифонах (сердцевидка) расположены глаза.
