3. Химияның бірігу кезеңі (химияның гылым ретінде кдлыптасуы). Бұл кезең XVI-XVIII ғасырларды камтиды және ол төрт мезгілден түрады: иатрохимия (медициналық химия), пневматикалық химия (газдар химиясы), флогистон теориясы және антифлогистондық жүйесі мезгілдері. Иатрохимия мезгілі Парацелъстің еңбектерімен және химияны "ұлы материя" — медицинаға қосу идеясымен сипатталады. Пневматикалық химия мезгілі газдарды зерттеу және газ тәріздес жәй денелермен қосылыстарды ашумен сипатталады. Бұл кезеңнің атақты ғалымы Роберт Бойль газ көлемінің қысымга тәуелдшігінің заңын ашты. Флогистон теориясы мезгілі XVII-XVIII ғасырларда Шталь ұсьшған флогистон теориясының таралуымен суреттеледі. Бүл теория жану және металдарды күйдіру күбылыстарын түсіндіру үшін қолданылған. Флогистон теориясының негізінде жататын денелердің қүрамынан жану мен күйдіру процесінде бөлініп шығатъш жалпы күрама бөлік—флогистон — бар деген ой болған. Флогистон теориясы химиялық процесс туралы алғашқы теория болып саналады. Антифлогистон жүйесінің; мезгілі Лавуазьенің еңбектеріне байланысты. Ол жану және күйдіру құбылыстарын зерттеу барысында оттегінің рөлін анықтап дәлелдеді және сол арқылы флогистон теориясының қате екендігін көрсетті. Сонымен қатар, Лавуазье химиялық элемент түсінігін анықтады, эксперимент жүзінде зат сақталу заңын ашты.