46
векторларды пайдаланады. Сонымен қоса,
клонданатын генді вектор
құрамынан оңай шығарып алу мүмкіндігін қарастырған маңызды.
Плазмидалық немесе фаг векторын таңдау гендік инженериялық
эксперимент жағдайына және клондау мақсатына қарай анықталады.
Плазмидалық векторлардың мӛлшері кіші, сондықтан олардың
рестрикциялау карталары салыстырмалы түрде қарапайым, бірегей
сайттарын табу ықтималдығы жоғары болады, нақты бір рестриктазаларды
таңдап алу және клонданатын фрагменттердің карталарын жасау
жеңілдейді, бұл бір артықшылығы. Бұған қоса, мұндай ДНҚ молекулалары
in vitro жағдайларда жұмыс жасау кезінде зақымдалмай сақталады,
себебі
ДНҚ-сы қысқа болады. Сонымен қоса, мультикӛшірмелі болып келеді.
Скрининг жасау кезінде рекДНҚ-ны гибридтеу әдісімен радиоактивті
зондтар арқылы анықтау ықтималдығы жоғары болады. Сондықтан да
кӛбінесе рекомбинациялық ДНҚ мӛлшері 10-15 мың жұп нуклеотидтерді
құрайды. Дегенмен, ұзындығы қысқарған сайын гендерді клондауға
қажетті бірегей сайттардың саны азая түседі. Бұл кемшілікті жою үшін
плазмидаларға полилинкерлерді енгізеді. 10-ға дейінгі және 10-нан асатын
әртүрлі клондау сайттары бар жасанды олигонуклеотидтер (белгіленуі:
MCS – multiple cloning sites). Бұл сайттар жеке немесе бӛгде ДНҚ
фрагменттері
интеграциялана алатындай, кез келген үйлесімде
пайдаланылуы мүмкін. Мұндай фрагменттерді кӛршілес сайттары
бойынша «кесуге» болады, ол жағдайда гендермен жұмыс жасау
мүмкіндіктері және олардың физикалық картасын жасау мүмкіндіктері
артады. Кейбір кездерде фаг векторларын қолдану қолайлы болады.
Бұлардың ерекшелігі құрастырылған вектор немесе рекДНҚ in vitro
жағдайларда фагтың бас бӛлігіне – капсидтерге жинақталады. Сол себепті,
оларды реципиент жасушаларға енгізу тиімділігі, іріктеу тиімділігі де
артады. Оқшаулап бӛлген кезде, олар бактериялық ДНҚ қоспасынсыз таза
күйде бӛлінеді.
Бактериофагтар - ДНҚ қос тізбекті жазық құрылымдағы cos-
бірізділіктері деп атайды. Салбыраңқы «жабысқақ»
ұштары бар бактерия
вирустары.
Кӛбінесе вектор ретінде λ-фагтар қолданылады. Оған қырық м.ж.н.
дейін бӛгде ДНҚ-ны енгізуге болады (М:Р1).
λ-бактериофаг геномы. λ-бактериофаг геномының ортаңғы бӛлігінде
лизогенияны (бактерия ДНҚ енгізілуін бақылайтын гендер болды,
шамамен 25 м.ж. құрайды). Бұл бӛлікті бӛгде ДНҚ фрагменті алмастыра
алады. Мұндай модификацияланған фагтар лизистік айналымды
ӛткергенмен лизогения жүрмейді (лизистік сыртқы қабықтың еруі). λ-
бактериофаг векторларын эукариот ДНҚ фрагменттерін неғұрлым ірі
гендерді (23 м.ж.н. дейін) клондау үшін қолданылады. Фрагмент
енгізілмеген фагтар – 38 м.ж.н. немесе тым ірі 52 м.ж.н. асатын фагтар
47
дами алмайды, М13, Т4, Т7 және λ фагтарды фаг
дисплейі әдісімен нәруыз-
нәруыз, нәруыз-пептидтік және ДНҚ –нәруыз әсерлесулері зерттеледі.
Фазмида – гибридтік вектор фаг және плазмида геномдарының
бӛліктерінен құралады. Фазмидаға клонданушы енгізгеннен кейін бір
жағдайда фаг ретінде, бір жағдайда фазмида ретінде дами алады. Әдетте
фазмида және фагтың нуклеотидтік бірізділігі кіреді. Бӛгде ДНҚ
плазмидалық векторда клондана алады. Мұндай рекомбинант плазмиданы
фаг геномына фаг АТТ сайттарының кӛшірмесін енгізуге болады. Фазмида
әрі қарай E.сoli-ге сәйкес штаммдарында плазмида немесе фаг ретінде
кӛбейтіледі.
Қалыпты және вирулентті бактериофагтардың бактерия жасушасымен
әсерлесуі алғашқыда бірдей болады:
бактериофаг жасушаның арнайы фагтарды сезгіш рецепторларына
адсорбицияланады;
фагтардың нуклеин қышқылы жасуша - иесіне инъекцияланады;
фаг
пен
бактерияның
нуклеин
қышқылдары
бірігіп
репликацияланады;
жасуша бӛлінеді.
Ары қарай бактериофаг екі жолмен дами алады:
лизогендік немесе
литикалық жол. Қалыпты бактериофагтар жасуша бӛлінгеннен кейін
профаг күйінде болады.
Вирулентті бактериофагтар литикалық жолмен дамиды:
фагтардың нуклеин қышқылы бактерияның нәруыз синтездеу
аппаратын пайдалана отырып, ӛз ферменттерін синтездеуге мәжбүрлейді.
Фаг ӛз иесінің ДНҚ мен РНҚ белсенділігінен айырып, ал фаг ферменттері
оларды ыдыратып жібереді.
фагтың нуклеин қышқылы репликацияланып, ӛз қабықшасының
нәруыздарын синтездеуді жүзеге асырады. Фагтың нуклеин қышқылы
маңында қабықша нәруыздары ӛздігінен
жинақталып, капсид түзіп, жаңа
фаг бӛлшектері түзіледі.
Фаг РНҚ-сының басқаруымен лизоцим синтезделеді. Жасуша лизисі:
жасуша лизоцим әсерінен жарылады, 200-1000 жуық жаңа фагтар босап
шығады. Фагтар басқа бактерияларды зақымдауға кіріседі.
Достарыңызбен бөлісу: