Экологиялық сараптама тұжырымдарының обьективтілігі мен ғылыми негізділік принципі – бұл мемлекеттік экологиялық сараптама қоршаған ортаға әсерді бағалау ғылыми зерттеу процесі екеніне он бүгінгі күні ғылыми-техникалық жетістіктерді, жаңа әдістерді қолдана отырып, экологиялық сараптаманың қорытындылары мен шешімдерді обьективті сипатта және экологиялық мүдделерді қорғаушы, сонымен қатар ғылыми деректерге негізделген қорытындылары ғылыми тұрғыда дәлелденген болып, білікті сарапшы мамандардың жасауы тиіс. Сарапшының міндеттерін қарастыратын болсақ, сарапшы экологиялық, сараптаманың обьективті сапалы және кешенді жүргізілуін қамтамасыз етсе, сараптаманы нормативтер мен ережелер және стандарттарға сүйене отырып, экологиялық сараптама қорытындысын қажетті айғақтармен дайындауы қажет (ҚР-ның «экологиялық сараптама туралы», 20-бап, 5 бөлім 1,3,5, Егемен Қазақстан, 1997.21март). Сонымен қатар, зерттеу нәтижесінде тек жіберілген қателер анықталып қоймай, ол қателіктердің зардаптары көрсетіліп, шешім қабылдайтын органдарға немесе жеке тұлғаларға ұсыныстар мен кемшіліктерді жою үшін не істеу қажеттігі көрсетіледі.
Бұл принцип қоршаған орта мен адам денсаулығын және өмірін қорғай отырып, экологиялық және экономикалық үйлесімділігін қамтамасыз етеді. Өйткені обьективті деңгейден ғылыми негізділік экологиялық зиянды әрекеттерден қорғану кепілдігі мен адамның салауатты өмірі мен бақытты тіршілігіне құқықтылығын қамтамасыз етеді.