Гетеретрофты микроорганизмдер метатрофты және паратрофты болып екіге белінеді. Метатрофтар немесе сапрофиттер өсімдіктер мен жануарлардың өлекселерімен қоректенеді. Бұларға топырақтағы және судағы әр түрлі органикалық заттарды ыдырататын және тағамдық заттарды бүлдіретін микрооргнизмдер жатады. Сонымен бірге көптеген бактериялар мен ашытқы саңырауқұлақтар, зең саңырауқұлақтары да сапрофиттер болып есептеледі. Ал паратрофтлар тек тірі организмдер белогында ғана кебейе алады. Бұған адам мен жануарлардың ауру қоздырушы микроорганизмдері жатады. Қөміртегінің көзі ретінде микроорганизмдер негізінен көмірсуларды, спирттерді және түрлі органикалық қышқылдарды (сүт, пропион т.б. қышқылдарды) пайдалана алады.