Монография под редакцией А. Л. Хохлова, Н. В. Пятигорской Отделение медицинских наук ббк 2. П86

ADME Suite и Tox Suite компании ACD/Lab [230], Discovery Studio ADMET 
Software компании Biovia [246], StarDrop компании Optibrium [427]. 
Из свободно доступных в сети Интернет вычислительных ресурсов от-
метим ADMET Prediction Service [231] разработанный сотрудниками Лабо-
ратории медицинской химии Химического факультета МГУ им. М. В. Ло-
моносова. 
В то же время, необходимо отметить, что использование фильтров на 
основе расчетных ADMET характеристик для «отсеивания» молекул, не 
удовлетворяющих рекомендуемым значениям параметров, необходимо про-
водить с определенной долей осторожности. Во-первых, значительная доля 
разрешенных к медицинскому применению лекарственных препаратов не 
удовлетворяет этим рекомендациям (ярким примером является применяе-
мая в течение более 100 лет в медицине ацетилсалициловая кислота, для 
которой оценка «drug-likeness» равняется 0,302). Во-вторых, в значитель-
ном числе фармацевтических исследований открытие «хитов» происходило 
на основе молекул, не удовлетворяющих рекомендуемым значениям, с по-
следующей оптимизацией их до соединений-лидеров, которые уже соответ-
ствовали рекомендациям. И, наконец, компьютерные прогнозы необходимо 
подтверждать в последующих экспериментальных исследованиях: наряду с 
«activity cliffs» могут существовать и «property cliffs», что может привести 
к неоправданной потере ценного фармакологического вещества на ранних 
стадиях исследований. 
Таким образом, фармацевтическое исследование представляет собой 
сложный многоэтапный процесс, требующий участия специалистов многих 
дисциплин, и базирующийся на самой современной информации. Посколь-
ку фармацевтическая разработка требует чрезвычайно больших финансо-
вых, временных и человеческих ресурсов, а также сопряжена с высокими 
рисками неудач [270], повышение эффективности поиска и конструирова-
ния новых фармакологических веществ требует применения современных 
методов медицинской биоинформатики. 
Вильям Йоргенсен в аналитическом обзоре, опубликованном в журнале 
Science в 2004 году [358], очень четко сформулировал проблему использова-
ния компьютерных методов в создании лекарств: ««Есть ли хоть один при-
мер того, что продаваемое в аптеке лекарство было разработано с помощью 
компьютера? Когда меня спрашивают об этом, я вспоминаю профессорскую 
мантру «Любой вопрос – это хороший вопрос», предчувствуя, что ожида-
емый ответ – «Нет». В этом случае задававший вопрос сможет вернуться 
в лабораторию в твердой уверенности, что его выбор не тратить время на 
изучение компьютерной химии является мудрым решением. Реальность, 
однако, такова, что сегодня использование компьютеров и вычислительных 
методов пронизывает все аспекты открытия лекарств. Наиболее квалифи-
цированные в области вычислительных методов конструирования лекарств 
специалисты обладают существенным преимуществом в разработке ори-
гинальных фармакологических веществ, что позволяет им создавать новые 

жүктеу/скачать 3,82 Mb.

Достарыңызбен бөлісу: