Полисахаридтер мен полифенолдар сияқты екінші метаболиттердің жоғары концентрациясына байланысты көптеген өсімдік түрлерінен ДНҚ-ны бөліп алу қиын мәселе болып саналады. Өсімдік ДНҚ-ны бөліп алу сынамаларда белоктардың, майлардың және ингибиторлардың болуына байланысты күрделі міндет. . Бұл мәселені шешудің бірнеше әдістері бар, ол үшін арнайы коммерциялық жиынтықтар жасалған.