Өсімдік жасушаларындағы ДНҚ жасуша қабырғаларын тиімді бұзуды қажет етеді. Бұл жағдайда ДНҚ-ны бөлшектеу процестерін барынша азайту өте маңызды. Кейде бұл қиындықты лиофилденген материалды қолдану арқылы жеңілдетуге болады. Келесі кезеңде босатылған жоғары молекулалық ДНҚ-ны өсімдік сығындысындағы қоспалардан - полисахаридтерден, белоктардан, липидтерден, пигменттерден және басқалардан тазарту қажет . Сондықтан жаңа объект үшін әдісті эксперименттік жолмен таңдау қажет болады.