Фотосинтетикалық фосфорлану. Фотосинтетикалық бактериялар фотофосфорлануды жүзеге асыра алады (циклдік және циклдік емес), бірақ олардың құрылымында Жоғары өсімдіктердің I немесе II фотосистемасына ұқсас бір ғана фотосинтетикалық реакция орталығы бар. Мұндай бактериялар суды электрондардың таусылмайтын көзі ретінде қолдана алмайтындықтан, бактериялық фотосинтез процесінде оттегі бөлінбейді және мұндай фотосинтез аноксигенді болады.
Циклдік емес фотофосфорлануды жүзеге асыратын бактериялар қалпына келтіру эквиваленттерінің (яғни электрондардың немесе сутегі атомдарының) доноры ретінде күкіртті сутекті немесе басқа күкірт қосылыстарын пайдаланады. Ерекшелік - бұл екі фотосистемасы бар және балдырлар мен жоғары өсімдіктер сияқты оттегімен фотосинтез жасай алатын цианобактериялар. Күлгін бактериялар өсімдіктер мен цианобактериялардың ФСИІ құрылымына ұқсас бір фотосистеманы пайдаланады, бірақ хлорофиллдердің орнына бактериохлорофиллдер алып жүреді, ал бактериофитин электронның бастапқы акцепторы ретінде қызмет етеді.
