Тіпті ежелгі грек дәрігері Гиппократ (шамамен б.д.д. 460-377 жж.) жұқпалы ауруларды көзге көрінбейтін тіршілік иелері тудырады деген болжам айтқан. Ибн Синна (шамамен 980-1037 жж.) «Медицина канонында» оба, шешек және басқа да аурулардың «көрінбейтін» қоздырғыштары туралы жазған. Осындай ойларды итальяндық дәрігер, астроном және ақын Г.Фракастроның еңбектерінде де кездестіруге болады. Оба ауруының қоздырғышын микроскоппен анықтауға тырысқан ресейлік эпидемиолог Д.С.Самойлович жұқпалы ауруларды тірі микроскопиялық тіршілік иелері тудыратынына терең сенімді болды, бірақ сол кездегі микроскоптардың мүмкіндіктері оған мүмкіндік бермеді. бұл. 1827 жылы итальяндық табиғат зерттеушісі А.Басси жібек құртының ауруын зерттей отырып, ауру адамнан сау адамға микроскопиялық саңырауқұлақ ауысқанда аурудың берілу жолын ашты. Осылайша, А.Басси бұл аурудың микроптық сипатын алғаш рет тәжірибе жүзінде анықтады.
Қазіргі микробиологияның бастауын ашқан – француз ғалымы Луи Пастер. Луи Пастердің ғылыми қызметі сол кездегі микроағзалармен байланысты басты мәселелер әр бағыттарда қарастырылған. Француз ғалымының үлкен еңбегін оның лаборатория ішіндегі тақтайшадағы жазбалардан көре аламыз:
«Бұл жерде Л. Пастердің зертханасы болды:
1857 – Ашу процесі.
1860 -- Өздігінен ұрықтандыру.
1865 -- Шарап пен сыра аурулары.
1868 ж. – Жібек құрт ауруы.
1881 -- Инфекция және вакцина.
1885 -- Құтырудан қорғану».
Сүт қышқылын, спиртті, май қышқылын ашытуды зерттей отырып, Л.Пастер бұл процестер микроорганизмдердің белгілі бір түрлерінің әсерінен болатынын және олардың тіршілік әрекетіне тікелей байланысты екенін анықтады. Кейін шараптың «ауруларын», жануарлар мен адамдардың ауруларын зерттей отырып, олардың «кінәлілері» де микроорганизмдер екенін тәжірибе жүзінде анықтады. Сонымен, Л.Пастер микроорганизмдердің қоршаған табиғатқа, оның ішінде адамға энергетикалық әсер ететін пайдалы немесе зиянды белсенді формалар екенін бірінші болып көрсетті.
Микробиология үшін ғана емес, сонымен қатар тіршіліктің мәнін оның әртүрлі көріністерінде тереңірек түсіну үшін түбегейлі маңызы бар Л.Пастердің өсімдіктер мен жануарлар әлемінде кездесетіндерге ұқсамайтын микроорганизмдердегі тіршіліктің жаңа түрлерін ашты. 1857 жылы Пастер алкогольдік ашытуды зерттей отырып, оның оттегіге қол жеткізе алмайтын ашытқылардың тіршілік әрекетінің нәтижесі екенін анықтады. Кейінірек, май қышқылының ашытуын зерттегенде, ғалым ашыту агенттерінің оттегіге теріс қатынасы бар екенін және оның еркін қол жетімділігін болдырмайтын жағдайларда ғана көбейе алатынын анықтады. Осылайша, Пастер «оттегісіз өмірдің», яғни анаэробты өмір сүру тәсілінің бар екенін ашты. Ол сондай-ақ молекулалық оттегінің бар немесе жоқтығындағы өмірге сілтеме жасау үшін «аэробты» және «анаэробты» терминдерін енгізді.
Л.Пастердің теориялық жаңалықтарына оның «өздігінен ұрықтандыру» мүмкін еместігі туралы еңбектері жатады. Тірі тіршілік иелерінің, соның ішінде микроорганизмдердің қайдан: өз түрінен немесе тірі табиғаттың басқа құрамдас бөліктерінен пайда болғаны туралы дау 19 ғасырдың ортасына қарай кең тараған көптен бері келе жатқан дау. үлкен қатал және таза ғылыми пікірталастардың шеңберінен әлдеқайда асып түсті. Жүргізілген тәжірибелер негізінде ғалым мынадай қорытындыға келді: «Жоқ, бүгінде микроскопиялық тіршілік иелері эмбрионсыз, оларға ұқсайтын ата-аналарсыз туылған деп айтуға болатын бірде-бір белгілі факт жоқ. Керісінше талап ететіндер қателердің немесе олар байқамаған немесе олардан аулақ бола алмаған қателері бар нашар орындалған эксперименттердің құрбандары болып табылады ».
Л.Пастердің жануарлар мен адамдардың жұқпалы ауруларын (жібек құрты, сібір жарасы, тауық тырысқағы, құтыру) зерттеу саласындағы еңбектері бұл аурулардың табиғатын білуге ғана емес, сонымен бірге күресудің жолын табуға мүмкіндік берді. Сондықтан Пастер жұқпалы ауруларды және олармен күресу шараларын зерттеуге арналған классикалық еңбектерімен медициналық микробиологияның дамуының негізін қалады деп дұрыс санауға болады.
Л.Пастердің еңбектерін замандастары жоғары бағалап, халықаралық деңгейде танылды. 1888 жылы халықаралық жазылымдар арқылы жиналған қаражатты пайдалана отырып, ғалым Парижде қазіргі уақытта өз есімімен аталатын ғылыми-зерттеу институтын салды. Пастер осы институттың бірінші директоры болды. Л.Пастердің ашқан жаңалықтары қарапайым көзге көрінбейтін микроәлемнің қаншалықты алуан түрлі, ерекше және белсенді екенін және оны зерттеудің қандай үлкен қызмет саласын көрсететінін көрсетті.
