- ағымдағы гепарин индукциялаушы тромбоцитопения немесе оның сыртартқыда болуы
- бауырдың, бүйректің ауыр жеткіліксіздігін, ойық жара ауруының өршуін, Крон ауруын, жедел немесе жеделге жуық сепсистік эндокардит, бассүйекішілік қан құйылу немесе жарақат және бас, мойын, көз, құлақ аумағына жасалатын операцияларды қамтитын және әйелдерде түсік тастау қатері, босану кезіндегі (соның ішінде таяудағы) жайылған немесе жергілікті қан кетуге бейімділік
Гепарин инъекциясы құрамында 10 мг/мл консервант – бензил спирті бар, сондықтан шала туған немесе жаңа туған балаларға қарсы көрсетілімді.
Гепарин алған жүкті әйелдерде босану кезінде эпидуральді анестезия қарсы көрсетілімді.
Гепаринді профилактика үшін емес, емделу үшін алатын науқастарда жоспарлы хирургиялық шаралар жасалғанда жергілікті-аймақтық анестезия қарсы көрсетілімді, өйткені Гепарин пайдалану өте сирек, бірақ ұзақ уақыт немесе тұрақты салдану нәтижесінде эпидуральді немесе жұлын гематомасының дамуымен астасады.