Машхур-Жусип получил по окончании медресе Кокельдаш в Бухаре высшее по тем временам мусульманское духовное образование. С 1875 года работал учителем в ауле. Записанные им из устных народных сказителей произведений Бухара жырау, Котеша, Шортанбая, Шоже стали богатым материалом для фольклористов, историков, литературоведов. Машхур-Жусип был известным краеведом. В частности, именно он установил место захоронения одного из великих народных жырау Бухара Калкаманулы. Бухар происходит из рода Аргын, предки Бухара – старшины, родоначальники, отец Бухара – Калкаман батыр.
В 1907 г. в Казани были опубликованы три его книги. Почти весь тираж книги «Сарыарқаның кімдікі екендігі» («О том, чья же Сарыарка») был изъят властями. Машхур-Жусип писал о массовом изъятии казахских земель, царская цензура объявила его труды вредными, и автор подвергся политическим гонениям. Автор на исторических материалах доказывал фактическую принадлежность степи ее истинным хозяевам – казахам. Машхур-Жусип был одним из активных авторов газеты «Киргизская степная газета», которая издавалась в Омске. В настоящее время изданы почти 20 томов материалов, собранных и написанных Машхур-Жусипом.
Шакарим с юности занимается рисованием, работой по камню, изобретает и кроит одежду, изготавливает скрипки, домбры. В 20 лет стал волостным управителем, видел тяжбы казахского народа, гнет со стороны царского правительства, был справедливым управителем. Свою должность волостного он оставил и стал заниматься творчеством и путешествиями начиная с 1898 года, уже после сорока лет.
Кроме сбора этнографических и исторических материалов, Шакарим Кудайбердиев написал «Зеркало казахов», поэмы «Калкаман – Мамыр» и «Енлик – Кебек». Также был и переводчиком: переводил «Метель» и «Дубровского» А.С. Пушкина, роман Г. Бичер-Стоу «Хижина дяди Тома». В 1903 г. он был принят членом Семипалатинского подотдела Западно-Сибирского отделения Императорского русского Географического Общества.
