Структура рекомбинационных сигналов Рядом с кодирующими участками сегмента в интронах расположены
специфические последовательности нуклеотидов (RSS), которые представляют собой
палиндромы, разорванные спейсером разной длины.
Существует правило 12/23, по которому сегменты могут соединяться только
если у одной последовательности спейсер 23, а другой 12, и наоборот.
Это позволяет избежать пропусков D
-
сегментов в тяжёлых и β
-
цепях. Соединением по
правилу 12/23 занят RAG
-
фермент.
Правило 12/23: ориентация сигналов в генах тяжёлых цепей иммуноглобулинов,
а также β и γ цепей TCR делает невозможной VJ
-
рекомбинацию в этих локусах.
Два белка RAG1 и RAG2 образуют тетрамер. За узнавание и расщепление ДНК
отвечает RAG1, а RAG2 стабилизирует тетрамер и следит, чтобы взаимодействие
происходило с компонентами транскрипционно активного хроматина. Эти два гена
-
обломки от некоторого предка современного транспозона, который попал в наши
клетки 500
млн лет назад.
RAG1 соединяет вместе V
-
и J
-
сегменты. Отрезает интрон, оставляя замкнутные
шпилечки.
Далее белки Ku70 и Ku80 держат их рядом. Шпильку раскрывает
протеинкиназа.
Терминальная дезонуклеотидилтрансфераза осуществляет внематричный синтез,
случайно навешивая нуклеотиды на свободные концы ДНК. Это увеличивает
разнообразие, но и создаёт риск сбоя рамки считывания, что приведет к дефектному
пептиду и провалу теста на стадии преВ
-
рецептора.
Два случайно сгенерированных конца слипаются. Лигаза сшивает. Отрезанный
интрон зашивается и образуется сигнальное кольцо, которое можно использовать для
детекции клеток, недавно вышедших из первичных лимфоидных органов.
В итоге V
-
и
J-
гены соединяются, при этом содержат случайно сгенерированные
нуклеотиды, которые кодируют рандомные аминокислоты.