Составляющие элементы днк-микрочипа
Использование результатов микрочипов генетического кода
жүктеу/скачать 35,47 Kb.
|
ДНК-микрочипы
- Бұл бет үшін навигация:
- 1.7 Преимущества технологии ДНК-микрочипов.
- 1.8 Недостатки микрочипов в применении.
| 1.6 Использование результатов микрочипов генетического кода.
Генетика и биологическая медицина используют практические и теоретические результаты микрочипов генетического кода. Регулярно проводятся исследования для анализа экспрессии генов, благодаря чипам. При этом выявляется информация четырех направлений: однонуклеотид; полиморфизм; генотипирование; сегментирование мутированных геномов. [1. https://testdnk.pro/informacia/chipy-dnk.html] 1.7 Преимущества технологии ДНК-микрочипов. очень высокая чувствительность; специфичность технологии; воспроизводство экспериментальных результатов; низкая себестоимость; возможность мультиплексности; простота реализации процедур. Микрочип имеет преимущество перед другими методами в том, что ошибки идентификации исключены. Риск перемещения, исчезновения, поломки относительно мал. Rao,Edmondson в 1990 провели мониторинг 140 имплантированных мышей в течение двух лет, и обнаружили, что 2% мышей потеряли свои чипы, и у 2,8% чипы не передавали данные. [1. https://www.s-vfu.ru/universitet/innovatsii/malye-innovatsionnye-predpriyatiya/llc-genodiagnostika/dna-microarray-technology/] [2. https://testdnk.pro/informacia/chipy-dnk.html] [3. https://vivariy.com/articles/markirovka-i-identifikaciya-laboratornyh-zhivotnyh] 1.8 Недостатки микрочипов в применении. Несмотря на достоинства ДНК-микрочипов, у них есть и недостатки в применении. Предполагается, что интенсивность сигнала (свечения), зарегистрированная в конкретном сайте микрочипа, линейно зависит от количества ДНК, которое прошло гибридизацию. Однако, на самом деле это далеко не всегда так: из-за кинетики гибридизации уровень сигнала, полученный в данной точке, не является линейной функцией от концентрации данной ДНК в образце. Таким образом, точно оценивать количество ДНК в образце можно лишь при некоторых изначальных концентрациях ДНК, которые, всё же, могут обеспечить линейную зависимость. Оценка изначально относительно больших или малых концентраций ДНК образца будет неточной. В сложных геномах эукариот, особенно млекопитающих, встречается множество гомологичных генов, последовательности которых очень сходны, что накладывает дополнительные условия на дизайн зондов для микрочипов. Зонд, сконструированный для одного гена A, может также «поймать на себя» ещё и гены B, C, D, являющийся гомологичными гену A, что будет искажать итоговую картину. Ещё одно ограничение связанно с тем, насколько большая база генов имеется на данный момент в распоряжении человечества. Если не показано существование какого-то гена, то и невозможен синтез соответствующего зонда, который будет располагаться на микрочипе. И никакие взаимодействия таких генов не могут быть обнаружены. Особенно актуальна эта проблема для прокариот: геномы даже близкородственных организмов могут значительно отличаться. Например, у вида бактерий Aggregatibacter actinomycetemcomitans геномы различных штаммов могут различаться на 20 % генов и, следовательно, микрочипы, сконструированные под один штамм, не смогут обнаружить другой. Среди недостатков микрочипирования необходимо также отметить, что они могут вызвать воспаление и рост фиброзной ткани, а в долгосрочной перспективе, увеличивают риск появления опухоли. Причинно-следственная связь между имплантацией микрочипа и рака описана у крыс и мышей. В пяти из восьми статей сообщается, что у 0,8 - 4,1% лабораторных мышей и крыс были обнаружены злокачественные опухоли вокруг или вблизи имплантации микрочипа. В одном из этих восьми исследований, была использована генетически модифицированная линия p53þ / 2 мышей, которые были склонны к развитию рака, и у 10,2% мышей были обнаружены злокачественные опухоли, и в ряде случаев метастазы. Опухоли, были обнаружены на второй год исследований, в среднем возрасте животных и старше. Проведенные исследования на гетерозиготных p53þ / 2 мышах показали наличие быстрорастущих раковых опухолей, ранее шестимесячного возраста. Таким образом, имплантация микрочипа, по-видимому, повышает риск развития опухолей. Это важно иметь в виду при проведении длительного исследования рака на крысах или мышах. [1. https://ru.wikipedia.org/wiki/ДНК-микрочип] [2. https://vivariy.com/articles/markirovka-i-identifikaciya-laboratornyh-zhivotnyh#] жүктеу/скачать 35,47 Kb. Достарыңызбен бөлісу:
|