Опыт 1
c
+
H
, моль/дм
3
0,01 0,05 0,10 0,20 0,30 0,40
k
1,эф
· 10
4
, мин
–1
28,6 142 285 570 855 1140
Опыт 2
c
OH
, моль/дм
3
0,01 0,05 0,10 0,20
0,30
0,40
k
2,эф
· 10
–3
, мин
–1
0,0975 0,4875 0,9750 1,950 2,925 3,900
Постройте графики зависимостей
+
эф
H
OH
(
,
)
k
f c
c
, определите по-
стоянные этих уравнений:
+
0
H
OH
,
,
k k
k
. Составьте общее уравнение за-
висимости
+
+
эф
0
H
H
OH
OH
k
k
k c
k
c
для реакции мутаротации глюкозы.
20. Скорость реакции иодирования ацетона проводят в присутствии
органических кислот, как катализаторов:
212
+
H
3
3
2
3
2
CH COCH + I
CH COCH I + HI
При стехиометрических соотношениях реагентов скорость этой ре-
акции не зависит от концентрации иода. Наблюдается функциональная
зависимость между наблюдаемой (эффективной) константой скорости и
значением константы диссоциации кислоты вида:
эф
a
n
k
K
. Изучив
экспериментальные данные, определите значения параметров
n
и
.
Кислота-катализатор
K
a
k
эф
, дм
3
/(моль c)
-хлорпропионовая
1,01 · 10
–4
5,9
Уксусная
1,75 · 10
–5
2,4
Пропионовая
1,34 · 10
–5
1,9
Триметилуксусная
9,10 · 10
–6
1,7
213
Г Л А В А 1 0 . КИНЕТИКА ФЕРМЕНТАТИВНЫХ
РЕАКЦИЙ
10.1. ОЦЕНКА КИНЕТИЧЕСКИХ ПАРАМЕТРОВ
ФЕРМЕНТАТИВНЫХ РЕАКЦИЙ
Рассмотрим самую простую реакцию превращения субстрата (S) в
продукт (Р) при участии фермента (Е).
Уже в ранних работах было обнаружено, что начальная скорость
ферментативной реакции, при фиксированной концентрации фермента
и малых концентрациях субстрата, изменяется линейно с концентрацией
субстрата, но для высоких концентраций субстрата скорость реакции
уже не зависит от его концентрации.
Л. Анри (1903 г.) первым предложил идею, что фермент образует с
субстратом промежуточный комплекс. Развил эту идею Л. Михаэлис.
Согласно этой идее, механизм процесса можно представить со-
стоящим из двух стадий. Первая — обратимая и быстрая, вторая — не-
обратимая и медленная:
1
2
1
E + S
ES
P + E
k
k
k
Для данного механизма скорость реакции определяется скоростью
образования продукта реакции Р:
P
2 ES
d
d
c
v
k c
t
. (10.1)
Скорость образования промежуточного продукта ES равна:
ES
1 S E
1 ES
2 ES
d
d
c
k c c
k c
k c
t
. (10.2)
Уравнения материального баланса для фермента и субстрата имеют
вид:
0
E
E
ES
c
c
c
и
0
S
S
ES
c
c
c
, (10.3)
где
0
0
E
S
и
c
c
— начальные концентрации фермента и субстрата;
E
S
и
c
c
— их текущие концентрации;
ES
c
— концентрации промежу-
точного соединения и продукта реакции.
214
Решение системы из трех уравнений (10.1)–(10.3) находим из сле-
дующих условий:
1) для
0
t
, 0
P
, следовательно
0
S
S
ES
c
c
c
;
2) обычно
0
S
c
>>
0
E
c
, поэтому
0
S
S
c
c
;
3) считают,
что
концентрация
промежуточного
соединения
ES
c
стационарна (на основе принципа стационарности Боденштейна),
т. е.
ES
d
0
d
c
t
.
Подставляя значение
ES
c
из (10.3) в (10.2) и решая его относитель-
но
ES
c
при условии
ES
d
0
d
c
t
, получим:
0 0
1 E S
ES
0
1 S
1
2
k c c
c
k c
k
k
. (10.4)
Поделим числитель и знаменатель этого уравнения на
1
k , тогда
имеем:
0 0
E S
ES
0
S
M
c c
c
c
K
. (10.5)
Величину
1
2
M
1
k
k
K
k
принято называть константой Михаэлиса.
Подставляя уравнение (10.5) в (10.1), получим уравнение для ско-
рости образования продукта в начальный момент времени:
0 0
2 E S
0
0
S
M
k c c
v
c
K
. (10.6)
Анализ уравнения (10.6) позволяет объяснить наблюдаемые на
опыте закономерности:
1) если
0
S
M
c
K
, тогда
0
0
2 E
0
S
M
k c
v
c
K
, (10.7)
215
то есть начальная скорость линейно зависит от концентрации субстрата.
Этот факт полностью подтверждается экспериментальными данными;
2) если
0
S
M
c
K
, тогда из уравнения (10.7) получаем:
0
0
max
2 E
v
v
k c
, (10.8)
то есть начальная скорость не зависит от концентрации субстрата, что
так же соответствует опытным данным. Следовательно, порядок реак-
ции по субстрату в этом случае будет нулевой, а скорость процесса дос-
тигает максимального значения. Поэтому уравнение (10.6) можно запи-
сать в виде:
0
max S
0
0
S
M
v c
v
c
K
. (10.9)
Уравнение (10.9) в литературе известно как уравнение Михаэлиса–
Ментена.
K
М
называется константой Михаэлиса, физический смысл ко-
торой можно сформулировать, анализируя уравнение (10.9).
Константа Михаэлиса численно равна концентрации субстрата
(
0
M
S
K
c
), при которой активность фермента составляет половину
максимальной, т. е.
0
max
/ 2
v
v
, и имеет размерность концентрации,
моль/дм
3
. Численные значения
K
М
обычно лежат в пределах 10
–2
–10
–8
М,
легко воспроизводятся и не зависят от концентрации фермента. В то же
время
K
М
является функцией температуры, рН среды, зависит от при-
сутствия других веществ, играющих роль ингибитора или активатора.
Если для рассматриваемого механизма реакции выполняется усло-
вие
1
k
>>
2
k , тогда
1
M
S
1
k
K
K
k
, где
S
K — субстратная константа,
т. е. константа диссоциации фермент-субстратного комплекса на фер-
мент и субстрат, характеризующая меру связывания фермента с суб-
стратом. В общем случае
M
S
K
K
, причем экспериментальное значение
M
K представляет собой максимальное значение
S
K .
Только для ферментов разложения пероксида водорода, каталазы и
пероксидазы, для которых
1
k
<<
2
k
, константа Михаэлиса
M
2
1
/
K
k k
сильно отличается от субстратной константы
S
K .
Величину
2
k
(размерность [
t
–1
]) называют также числом оборотов
фермента, так как она указывает на число моль субстрата, превращен-
ных в продукт одним молем фермента в единицу времени. Для сложных
216
реакций константу
2
k
в уравнении Михаэлиса–Ментена обычно заме-
няют на
кат
k — каталитическую константу с той же размерностью.
Для определения параметров
M
K
и
max
v
используют несколько спо-
собов лионеризации уравнения Михаэлиса–Ментена.
Первый способ (способ Лайнуивера–Берка)
Уравнение (10.9) приводят к виду:
M
0
0
max
max
S
1
1
1
K
v
v
v
c
. (10.10)
График прямой, построенной в координатах
0
0
S
1
1
v
c
, отсекает отре-
зок на оси ординат, равный
max
1
v
. Тангенс угла наклона прямой равен
M
max
K
v
. Константу
M
K можно определить по отрезку, отсекаемому прямой
на оси абсцисс, так как при
0
1
0
v
имеем соотношение:
M
0
max
max
S
1
1
K
v
v
c
,
откуда
0
M
S
K
c
.
Второй способ (вторая форма уравнения Лайнуивера–Берка)
Уравнение (10.10) умножают на
0
S
c
:
0
0
S
M
S
0
max
max
1
c
K
c
v
v
v
. (10.11)
217
График в координатах
0
S
0
c
v
–
0
S
c
представляет собой также прямую,
отсекающую на оси ординат отрезок, равный
M
max
K
v
, а на оси абсцисс —
отрезок, равный
M
K .
Третий способ (способ Эдди–Хофсти)
Если умножить обе части уравнения (10.10) на (
max 0
v v
), то оно при-
водится к виду:
0
0
max
M
0
S
v
v
v
K
c
. (10.12)
График, построенный в координатах
0
0
0
S
v
v
c
, дает прямую линию,
тангенс угла наклона, которой равен
M
K
, а отрезок, отсекаемый на оси
ординат, равен
max
v
. Кроме того, отрезок, отсекаемый на оси абсцисс,
равен
max
M
v
K
, так как при
0
0
v
0
max
M
0
S
v
v
K
c
или
max
0
0
M
S
v
v
K
c
.
Указанные способы лианиризации уравнения Михаэлиса–Ментена
охватывают различные области концентрации субстрата, когда возмож-
ны отклонения от линейности. Поэтому полезно значения
M
max
и
K
v
, оп-
ределенные различными способами, сравнивать между собой.
Нетрудно показать, что аналогичная (10.9) форма уравнения может
быть получена и для более сложных механизмов реакции. Например,
когда субстрат взаимодействует с ферментом по схеме:
1
3
2
1
1
E + S
ES
ES + X
E + Y
k
k
k
k
Выражение для начальной скорости имеет вид:
0 0
2
E S
0
0
M
S
k c c
v
K
c
, (10.13)
где
3
2
3
k
k
k
. Это уравнение аналогично по форме уравнению Миха-
элиса–Ментена и также легко линеаризуется.
218
Возможно протекание более сложных ферментативных реакций с
участием двух субстратов.
10.2. ВЛИЯНИЕ ИНГИБИТОРОВ НА КИНЕТИКУ
ФЕРМЕНТАТИВНЫХ РЕАКЦИЙ
Вещества, присутствие которых в системе понижает актив-
ность фермента, то есть уменьшает скорость реакции, называ-
ются ингибиторами.
Эффект ингибирования может происходить по разным причинам.
1. Ингибитор I конкурирует с субстратом за активный центр, так как
по строению близок к нему и является псевдосупстратом, образуя с
ферментом неактивный комплекс:
1
1
E + I
EI
k
k
Константа диссоциации комплекса ЕI называется константой инги-
бирования:
E I
I
EI
c c
K
c
.
Начальная скорость реакции в присутствии ингибитора всегда
меньше, чем при его отсутствии.
Если при увеличении концентрации субстрата в растворе актив-
ность фермента восстанавливается, такое ингибирование назы-
вается конкурентным.
Предельное значение скорости не зависит от присутствия ингиби-
тора:
0
max
2 E
v
k c
.
Уравнение Михаэлиса–Ментена в присутствии ингибитора в этом
случае имеет вид:
0
max S
0
0
S
M,эф
v c
v
c
K
, (10.14)
219
где
0
I
M,эф
M
I
1
c
K
K
K
—
(10.15)
эффективная константа, зависящая от
0
I
c
и
I
K
.
Если
0
I
I
c
K
и
0
S
M
c
K
, то скорость реакции ингибирования будет
равна
max
/ 3
v
.
Выражение для константы ингибирования выразим из (10.15):
0
I
I
M,эф
M
/
1
c
K
K
K
. (10.16)
Таким образом, для определения
K
I
, кроме
0
I
c
,необходимо знать
эффективную константу реакции в присутствии ингибитора и константу
Михаэлиса — в его отсутствие.
M,эф
M
и
K
K
можно найти, решая задачу
графическим методом, например, в координатах Лайнуивера–Берга:
0
0
S
1
1
v
c
, для случая протекания процесса с ингибитором и без ингибито-
ра. Константу ингибирования можно рассчитать по уравнению (10.16)
или определить непосредственно из графика, так как отношение танген-
сов угла наклона прямых в точке пересечения с осью ординат равно
0
I
I
1
c
K
.
2. Ингибитор не конкурирует с субстратом за активный центр, так как
присоединяется к другой части молекулы белка с образованием
неактивных комплексов (EI и ESI), имеющих константы равновесия:
E I
I
EI
c c
K
c
,
ES I
ESI
c c
K
c
(10.17)
Наличие ингибитора в этом случае приводит к снижению активно-
сти фермента, но не изменяет его сродство к субстрату.
Если достигается обратимость ингибирования, то есть восста-
новление активности фермента под действием отличных от суб-
страта веществ, такое ингибирование называется неконкурент-
ным.
220
Если оба комплекса (EI и ESI) неактивны, то есть не дают продук-
та, а константы их диссоциации близки между собой (
I
K
K
), то это
равносильно дополнительному условию: ингибитор не мешает взаимо-
действию субстрата с ферментом, но уменьшает скорость реакции из-за
неактивности образующихся комплексов на поверхности фермента.
В этом случае константа Михаэлиса остается постоянной величи-
ной, а изменяется максимальная скорость процесса:
max
max,эф
0
I
I
1
v
v
c
K
. (10.18)
Уравнение Михаэлиса–Ментена в этом случае запишется как
0
max,эф S
0
0
S
M
v
c
v
c
K
. (10.19)
Если
0
I
I
c
K
и
0
S
M
c
K
, то скорость реакции ингибирования будет
равна
max
/ 4
v
.
Выражение для константы ингибирования получим из (10.18):
0
I
I
max
max,эф
/
1
c
K
v
v
. (10.20)
Линеаризация уравнения (10.19) и обработка экспериментальных
данных для неконкурентного ингибирования в координатах
0
0
S
1
1
v
c
по-
зволяет определить
M
max
max,эф
I
,
,
и
K v
v
K , зная
0
I
c .
3. При бесконкурентном ингибировании образуется один неактивиро-
ванный комплекс (ESI) с константой равновесия
ES I
ESI
c c
K
c
. (10.21)
Уравнение Михаэлиса–Ментена в этом случае запишется как
0
max,эф S
0
0
S
M ,эф
v
c
v
c
K
, (10.22)
221
где
M
M,эф
0
I
I
1
K
K
c
K
. (10.23)
В этом случае эффективная константа отличается от значения для
конкурентного ингибирования, но эффективная скорость выражается
уравнением, аналогичным для неконкурентного ингибирования.
Линеаризация уравнения (10.22) и обработка экспериментальных
данных для неконкурентного ингибирования в координатах
0
0
S
1
1
v
c
по-
зволяет определить
M
M,эф
max
max,эф
I
,
,
,
и
K
K
v
v
K , зная с
I
0
.
10.3. ПРИМЕРЫ РЕШЕНИЯ ЗАДАЧ
Пример 1.
Рассчитайте значение константы Михаэлиса и значение
максимальной скорости (
M
K и
max
v
) всеми возможными методами для
реакции гидролиза метилового эфира N-бензоил-L-аминомасляной,
катализируемого
-химотрипсином. Известны данные о зависимости
начальной скорости от концентрации субстрата:
0
S
c ·10
3
, М
2,24 2,24 1,49 1,49 1,12 1,12 0,90 0,90 0,75 0,75
0
v
· 10
7
, моль/с
4,25 4,31 3,52 3,60 3,10 3,12 2,71 2,77 2,45 2,40
Р е ш е н и е . Для графического решения преобразуем уравнение
Михаэлиса–Ментена в линейную форму.
1-й способ Лайнуивера–Берка
Уравнение приводится к виду:
M
0
0
max
max
S
1
1
1
K
v
v
v
c
.
Рассчитанные значения
0
S
1
c
,
0
1
v
заносим в таблицу и строим график
в соответствующих координатах.
222
0
S
1
c · 10
–2
, М
–1
4,46 4,46 6,71 6,71 8,93 8,93 11,11 11,11 13,33 13,33
0
1 v
· 10
–6
, с/моль 2,35
2,32 2,84 2,78 3,23 3,21 3,69 3,61 4,08 4,17
0
4
8
12
16
1
2
3
4
5
1/
v
0
· 1
0
6
, c
/мо
ль
1/c
S
0
· 10
2
, M
1
Отрезок на оси ординат получается равным 1/v
max
= 1,45 · 10
6
, по-
этому v
max
= 1/(1,45 · 10
6
) = 6,9 · 10
–7
моль/с.
Тангенс угла наклона прямой равен tg
= 2000, следовательно
K
М
= tg
· v
max
= 2000 · 6,9 · 10
–7
= 1,38 · 10
–3
М.
2-й способ Лайнуивера–Берка
Строят график по уравнению
0
0
S
M
S
0
max
max
1
+
c
K
c
v
v
v
в координатах
0
S
0
c
v
–
0
S
c .
0
S
c 10
3
, М
2,24 2,24 1,49 1,49 1,12 1,12 0,90 0,90 0,75 0,75
0
S
0
c v · 10
–3
, с/моль
5,27 5,20 4,23 4,14 3,61 3,59 3,32 3,25 3,06 3,13
223
-2
-1
0
1
2
3
2
4
6
c
S
0
·10
3
, M
c
S
0
/v
0
·10
3
, c/дм
3
Из графика получается, что прямая отсекает на оси ординат отре-
зок, равный
M
max
K
v
= 2 · 10
3
, а на оси абсцисс отрезок, равный K
М
=
= –1,38 · 10
–3
. Поэтому K
М
= 1,38 · 10
–3
М, v
max
= 1,38 · 10
–3
/(2 · 10
3
) =
= 6,9 · 10
–7
моль/с.
Способ Эдди–Хофсти
Уравнение приводится к виду
0
0
max
M 0
S
v
v
K v c
.
Строится график в координатах v
0
–
0
0
S
v c .
0
0
S
v c · 10
4
, дм
3
/с
1,90 1,92 2,36 2,42 2,77 2,79 3,01 3,08 3,27 3,20
v
0
· 10
–7
, с/моль
4,25 4,31 3,52 3,60 3,10 3,12 2,71 2,77 2,45 2,40
0
1
2
3
4
5
0
2
4
6
8
v
0
/c
S
0
· 10
4
, дм
3
/c
v
0
·
1
0
7
, мол
ь/
с
224
График дает прямую линию, тангенс угла которой равен
–1,36 · 10
–3
, а отрезок, отсекаемый на оси ординат, равен 6,86 · 10
–3
. По-
этому K
М
= 1,36 · 10
–3
М, v
max
= 6,86 · 10
–3
моль/с.
Достарыңызбен бөлісу: |