Монография под редакцией А. Л. Хохлова, Н. В. Пятигорской Отделение медицинских наук ббк 2. П86



Pdf көрінісі
бет69/334
Дата24.11.2023
өлшемі3,82 Mb.
#193454
түріМонография
1   ...   65   66   67   68   69   70   71   72   ...   334
Байланысты:
Хохлов 2

Глава 2. Прогнозирование свойств фармакологических веществ in silico
75


Если, например, величина Pa равна 0,9, то для 90% соединений из об-
учающей выборки, проявляющих эту активность, значение B статистики 
меньше, чем для исследуемого соединения, и только для 10% – больше. И, 
соответственно, если мы отклоним предположение о том, что это соеди-
нение обладает активностью, то, в среднем, мы с вероятностью 0,9 совер-
шим ошибку. Если же величина Pa меньше 0,5, то, следовательно, более 
половины активных соединений из обучающей выборки имеют значение 
B статистики больше, чем для данного соединения, и если мы отклоним 
предположение о том, что оно обладает активностью, то совершим ошибку 
с вероятностью менее 0,5. 
Другой важный аспект интерпретации результатов прогноза связан с но-
визной анализируемого соединения по сравнению с соединениями в обуча-
ющей выборке. Результатам прогноза 0,3<
Pa
<0,7 примерно соответствуют 
наиболее вероятные структуры активных соединений в SAR Base (наиболь-
ший наклон 
Pa
на рисунке 15), хотя оно может и сильно отличаться от всех 
соединений с данной активностью в SAR Base, но, вероятнее всего, оно 
«такое же». Если же 
Pa
>0,7, то шансы обнаружить активность в экспери-
менте довольно высоки, и соединение, скорее всего, сочетает в себе наибо-
лее важные особенности активных соединений, имеет очень мало общего с 
остальными соединениями в SAR Base (левый нижний угол на рисунке 15) 
и даже может оказаться родоначальником нового химического класса для 
рассматриваемого вида биологической активности. 
Возможности PASS ограничены перечнем прогнозируемых видов ак-
тивности, который составлен с учетом современного состояния фармако-
логической науки, и источниками данных о результатах экспериментально-
го исследования органических соединений на биологическую активность. 
Создание новых биологически активных веществ – динамично развива-
ющаяся область, постоянно претерпевающая как количественные, так и 
качественные изменения. Появляются новые термины, характеризующие 
биологическую активность, например, “Drugs Modulating Gene Expression”, 
“Transcription Factor Ligands”, “Translation Initiation Factor Inhibitors” [260] 
или “Modulators of Alternative Splicing” [241], и др. Усложняется наше по-
нимание связей между молекулярными механизмами действия и вызывае-
мыми ими фармакотерапевтическими эффектами, что привело к появлению 
и развитию «сетевой фармакологии [333]. Соответственно, необходимы 
постоянные усилия, направленные не только на то, чтобы пополнять обу-
чающую выборку PASS новыми данными о структуре и биологической ак-
тивности органических соединений, но и существенным образом уточнять 
понятийный аппарат описания химико-биологических взаимодействий в 
ряду «лиганд – мишень – биологический процесс – болезнь» [436]. 
Кроме того, необходимо отметить, что критерии отнесения соединений 
к «активным» и «неактивным» также изменяются со временем. В случае 
исследования новых мишеней, для которых лиганды либо не известны, 
либо их активность сравнительно невысока, соединения со значениями 
IC
50
<100 мкМ могут рассматриваться как активные. Если для рассматри-
76


Достарыңызбен бөлісу:
1   ...   65   66   67   68   69   70   71   72   ...   334




©engime.org 2024
әкімшілігінің қараңыз

    Басты бет