Жалпы,өндірісте ферментация улкен рөл атқарады. Әсіресе микроорганизмдермен жұмыс жасаған кезде ең басты ереже ол залалсыздандыру.Ферментация кезінде дақылдың бөгде заттармен ластанбауынан сақтайтын ортаны,кіріп-шығатын ауаны,сәйкесінше биореактор жабдықтарын залалсыздандырады. Орталар үшін көбінесе жылу арқылы залалсыздандыруды пайдаланады.Залалсыздандырудың жуандығы микроорганизм түріне,ортаның құрамына,ph көрсеткіштеріне,суспензияланған бөлшектерге байланысты. Зертханада толыққанды заласыздандыруға аз уақыттың ішінде оңай автоклавтау арқылы қол жеткізуге болады.
