Биотехнология өндірісінің 5 кезеңі бар. Екі бастапқы кезең шикізат дайындау және биологиялық белсенді ингредиент жатады. Инженерлі эхнимологияда процестер әдетте қажетті ферменттерді берілген қасиеттерімен (рН, температура, концентрациясы) субстрат ерітіндісін дайындау және осы ферментті немесе иммобилизденген препараттар дайындау. Микробиологиялық синтезді жүзеге асыруда тұрақты қоректік орта мен таза культураны пайдалану қажет. Штамм-продуцентті таза культурада ұстау – кез-келген микробиологиялық өндірісітің басты міндеті, қажетті қасиеттері бар өнім алуда бұл өзгертулер кепілдік бола алады.